【医药学论文】microRNA101在子宫颈Hela细胞和Siha细胞中
1 研究对象
1.1 细胞株
购自上海细胞库的人宫颈癌细胞Hela , 人子宫颈鳞癌细胞Siha,人食管鳞癌细胞Eca109进行研究。
1.2 miR-101的mimics和inhibitor
miR-101的mimics和inhibitor由上海英骏生物技术有限公司设计并合成,并带有荧光标记。
同时还合成了mimics和inhibitor的阴性对照。
1.3 引物设计与合成
PCR引物由上海英骏生物技术有限公司合成
Real-time PCR引物探针序列如下表:
U6-F CTCGCTTCGGCAGCACA
miRNAs通用Sense引物 GTGCAGGGTCCGAGGT
hsa-miR-101-RT GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACTTCAGT
1.4 主要试剂
胎牛血清(FCS): Gibico 公司,美国
胰蛋白酶酶:Gibico公司
Trizol: Invitrogen 公司,美国
DEPC: Amreseo 公司,美国
兔抗人β-tubulin 多克隆抗体:SantaCruz 公司,美国
RIPA裂解液:北京百泰克公司
EP管和离心管:Axygen公司,美国
Rnase: Invitrogen 公司,美国
DAB显色试剂盒:北京中杉金桥生物技术有限公司
Taq DNA聚合酶:Takara公司
其他试剂,如:氯仿、异丙醇、无水乙醇、甲醛等均为国产分析纯。
实时荧光定量PCR仪IQ5:BIO-rad 公司,美国
倒置显微镜:OLYMPUS 公司,日本
干燥箱:202-2型,上海市实验仪器总厂
电热恒温箱:DNp9082,上海精密实验设备有限公司
制冰机:SIM-F124 型,SANYO公司,日本
超纯水装置:Milli-Qplus 型,Millipore 公司,美国
台式低速离心机:TD5A-WS,上海湘仪离心机仪器有限公司
微型离心机:Mini-41c,珠海黑马医学仪器有限公司
立式压力蒸汽灭菌器:YXQ-LS-3011,上海博迅实业有限公司医疗设备厂
电子天平:赛多利斯公司,美国
高速离心机:5810R、5415D,Eppendorf 公司
2 内容与方法
2.11 复苏细胞及培养
2.1.2 细胞传代
2.1.3 细胞冻存
2.1.4 细胞接种
2.1.5 细胞计数
2.2 细胞转染步骤
转染前一天,每孔板的细胞弃去培养液,加入500ul的OPti-MEM,这样可以使细胞处于同步的饥饿状态。
用50ul DEPC 水重悬1OD的siRNA(mimics/ inhibitor 以及阴性对照的siRNA),震荡混匀溶解。
(1)稀释1ul microRNA-101的mimics/ inhibitor于50ul OPti-MEM中,混匀。
(3) 将稀释后的mimics/ inhibitor和lipofectamine2000混匀,放置20min。
(1)将siRNA- lipofectamine2000 复合物每培养瓶加入10ul, 24孔细胞培养板每孔加入1ul, 96孔细胞培养板每孔加入0.5ul,
(3)24小时后弃去原来的培养液,换成含10%胎牛血清的培养液。
2.3 实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative PCR, qRT –PCR)
导致RNA降解的最主要的物质是RNA酶,它的生物活性稳定并且可以广泛分布在灰尘中、各种实验器皿上、实验试剂中以及人体分泌的汗液唾液中。因此在进行提取RNA进行RNA分析技术的过程中最关键的因素是尽量减少RNA酶的污染,控制其对RNA的降解作用,实验过程中应该采取以下措施:
(2)Eppendorf管和枪头等采用一次性RNase-free的塑料制品。玻
(3)溶液配置: 配置的各种溶液应加入0.1%DEPC在37℃处理12-16h,然后高
2.3.1 细胞总RNA的提取
(2)将吹打完的悬浮液移入1.5ml 离心管中,用移液枪吹打40下至完全混匀,冰上放置5 min。
(4)这时离心完的液体已经分层,调50ul的移液枪慢慢轻轻吸取上清液至另个一1.5ml无菌离心管中并做好标记,大概移400ul左右。
(6)弃去上清,在离心管底部可以看见少许白色沉淀,即为RNA 样品,然后用70%乙醇1000ul漂洗一次,4℃ 7500 rpm 离心5min,弃去上清,剩下的液体拿1ul小枪慢慢将其洗干净,在通风橱室温晾干。
2.3.2 注意事项:
Trizol的量太少,可以再补加Trizol。
2.3.3 逆转录反应合成cDNA
2.4 MTT法
将处于对数生长期的Hela, Siha, Eca109细胞以每孔103-104个细胞均匀的接种于96孔细胞培养板中,每孔体积200ul, 四周边缘用无菌PBS 填充。
(1)阴性对照组和上调实验组,下调实验组按每孔分别用0.5ul的阴性siRNA ,0.5ul mimics, 0.5ul inhibitor加入25ul OPti-MEM的量加入至离心管中, 正常实验组直接加25ul OPti-MEM。
(3)室温孵育5min。
(5)将RNA- lipofectamine2000 复合物以每孔30ul均匀滴入各组转染孔再各加入170ul无血清无抗生素的培养液,24小时后弃去原来的培养液换成含10%胎牛血清的培养液放入细胞培养箱继续培养。
(7)在490nm 波长下用酶标仪测定各孔吸光度值,记录结果,绘制生长曲线并计算细胞的生长抑制率。
(1) 应选择适当的细胞接种浓度和培养时间,浓度不易过多,细胞代数不易超过2代。
(3) 设置空白孔(细胞、药物溶解介质、培养液共100ul、10ulMTT 、100ul二甲基亚砜)。
(5)培养过程中48h应该换液一次,因为100ul的培养液对于104-105次方的增殖期细胞来说,很难维持50h以上,如果营养不够的话,细胞会由增殖期渐渐趋向G0期而趋于静止,影响实验结果。
(7)判断污染。如加入MTT后都有个别孔立即变为蓝黑色,则污染的可能性极大。在加MTT前可以先在镜下观察,看看是否有孔染菌,染菌的孔常常是临近的。
2.5 细胞凋亡
(2)24小时后,将阴性对照组,正常组,上调实验组,下调实验组中培养瓶里的细胞消化下来,1000rpm 离心5min,弃去上清液,加入PBS后再次离心,之后将细胞收集于1.5ml的离心管中。
2.5.2 注意事项:
(2)特殊细胞的染色方法:在消化或吹打时,有些细胞(如神经元细胞)很容易受到损伤,导致晚期凋亡或坏死比例非常高,不能反映真实结果。实验的解决方法可以先低速离心,吸取细胞培养板中的液体,留少许液体,加入适量PI和Annexin-V染色10min后,将漂浮细胞吸至离心管中,离心洗涤两次,用PBS漂洗贴壁细胞两次,加胰酶消化后将细胞悬液移至另一离心管中,离心洗涤,再与漂浮细胞合并后上流式细胞仪检测。应用该法可降低晚期凋亡和坏死比例,增加早期凋亡细胞比例。
(4)必须设置阴性对照和补偿对照(分别转染)。
(1)取对数生长期的细胞,以3×104个细胞每孔的细胞悬液均匀接种于24孔细胞培养板,置于37℃,5%CO2孵育箱内孵育。
(3)观察24孔细胞培养板中细胞的生长密度,直到到达80%-90%融合。
(5)PBS洗涤一次,加入新的培养液。
2.7 免疫组化
(2)24h 后观察细胞生长状态并进行转染,实验分组同前,每组设三个复孔。
(4)4%多聚甲醛处理(室温)20min。
(6)3% H2O2处理细胞15min。
(8)将一抗用PBS按1:100稀释,每孔加入一抗50ul,阴性对照孔用PBS代替一抗。然后4℃冰箱内过夜。
(10)二抗(COX-2或EZH2)孵育,37℃,20min。
(12)DAB显色:DAB试剂盒中的A、B、C三种试剂按500ul 蒸馏水中各加4ul,混匀,在镜下观察显色情况,在没有背景的条件下可继续显色,一般在2-10min。
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