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深度学习及其在医疗信息领域的应用

来源: 2018-11-10 13:25

   [摘 要] 近些年来,深度学习迅速成为机器学习领域最为炙手可热的一个分支,深度学习概念提出之后,语音识别和计算机视觉等方面得到了飞速的发展。而随着现如今医疗信息化和数字化诊断的发展,医疗监测指标的不断增长,数据量越来越庞大,需要深度学习强大的数据处理能力为医疗领域提供有力的支持。本文从深度学习两个经典模型――DBN和CNN出发,介绍了深度学习在医疗信息领域中的应用,并对深度学习在医疗信息领域的发展进行了展望。 
  [关键词] 深度学习;CNN;DBN;医疗信息 
  doi : 10 . 3969 / j . issn . 1673 - 0194 . 2018. 13. 076 
  [中图分类号] TP391.4 [文献标识码] A [文章编号] 1673 - 0194(2018)13- 0169- 02 
  0 引 言 
  数据作为人工智能的燃料,其重要性不言而喻。现如今,随着各个行业间信息化程度的加深,积累的数据量越来越多,然而数据的处理能力却远远跟不上数据量的指数型增长。为了得到准确的结果,就必须收集更多的数据,而数据越多则处理速度越慢。这与我们收集数据的初衷背道而驰。而深度学习的出现解决了如何快速处理海量数据的问题。 
  近些年来,随着科技的进步,医疗行业得到了突飞猛进的发展,在医疗行业展开工作的同时,更多的信息也不断涌现,这些医疗信息的重要性不言而喻。因此,若能使用深度学习技术辅助疾病诊断,高效地处理患者资料中的数据,筛选出有利用价值的信息,挖掘出有价值的诊断规则,进而更好地做出疾病诊断结论,提高诊断效率,其前景是非常广阔的。 
  1 深度学习 
  深度学习的学名又叫深层神经网络(Deep Neural Network),由人工神经网络模型发展而来。深度学习根据其解决问题、应用领域的不同分为多种深度神经网络模型。其中较为热门的当属卷积神经网络(Convolutional Neural Network, CNN)和深度置信网络(Deep Belief Networks, DBN)。 
  1.1 深度信念网络DBN 
  DBN由若干层神经元组成,其组成元件是限制玻尔兹曼机(Restricted Boltzmann Machine,RBM)。DBN是一种贪婪的逐层学习的算法,可以使深度置信网络的权重达到最优化[1]。 
  要阐述DBN模型的构建过程,首先需要了解RBM。RBM是一种神经感知器,有两层网络组成,一层叫显层(visible layer),用于输入训练数据。一层叫隐层(hidden layer),用于做特征检测器。将若干个RBM进行“串联”,则上一个RBM的隐层即为下一个RBM的显层,上一个RBM的输出即为下一个RBM的输入。 
  1.2 卷积神经网络CNN 
  CNN是一种热门的深层深度学习模型,卷积神经网络核心的关键思想是局部连接、权值共享、池化和多层堆叠。权值共享是CNN相较于其他模型具有独特优越性的关键。它减少了神经网络中参数的个数,从而降低了网络的复杂度,使其更类似现实的生物神经网络。 
  CNN模型一般来说含有三个部分:卷积层、池化、全连接层。卷积层中神经网络不再对图片中的每个像素对处理,而是通过一个滤波器(即卷积核)对图片中每一小块像素区域进行扫描,提取局部特征和其位置关系。在获取了这些特征后,再进一步对这些特征进行分类。 
  2 深度�W习在医疗信息领域的应用 
  电子病例中包含了大量的数字和文本信息,是医务人员为患者开展相关治疗的实录,包括患者症状、用药记录、治疗情况等等。通过对信息进行抽取,得到有用的医疗数据,并加以有效利用,既可以为医疗提供决策支持,更可以为患者提供个性化诊疗方案,实现精准医疗。 
  临床数据,尤其是重症监护病房(ICU)电子病历,通常由多变量时间序列组成。ZacharyC.Lipton 等首次提出评估使用长短期记忆模型(LSTM, Long-Short Term Memory)识别多变量序列的临床病历的能力。他们使用诊断的多标签分类,训练模型分类为128种诊断,其模型效果优于此前使用多层感知器的研究方法[2]。R Miotto 等提出了一种新的无监督深度特征学习方法,此方法可以在电子病历中获取一个病人的病理特征,使得针对性的临床预测建模更加方便。他们训练三层堆叠的降噪自动解码器辨别70万患者电子病历中的层次规律和依存关系。他们将得到的模型称为“深度患者”,其在严重糖尿病、精神分裂症及各种癌症的预测上表现出色[3]。Nguyen P 等提出了一种端到端深度学习系统Deepr,此系统可以从病历记录中提取病理特征并自动预测。其构建的“深度记录”可以提高临床诊断的准确性[4]。WU Y 等构建了一种针对中文电子病历命名体识别的深度神经网络。通过无监督学习将未标记的语料库生成词作为输入层,实验结果表明其模型优于其他CRF(Conditional Random Field,条件随机场)模型[5]。吴嘉伟提出一种针对英文电子病历的实体关系抽取的特征学习方法,针对电子病历中文本结构稀疏的特点,将有限的上下文特征进行抽象表示,进而发掘出词与词之间的组合关系特征[6]。 
  3 结 语 
  目前,市场上已经有使用深度医学技术于医疗的企业。例如IBM的Watson,它可以作为线上辅助医疗工具帮助医生诊断病情。医生将患者的病症输入,可以在Watson中得到包含一系列治疗计划的诊断反馈。目前Watson已经可以做到在十分钟之内检测出罕见的白血病。 
  尽管如今深度学习之风已经刮遍医疗行业的许多角落,但很多实际问题依然很难实现和操作。现如今,大部分深度学习研究还停留在训练模型的阶段,要转化为真实有效的产品,通过从临床验证到监管批准的层层考验还要有很长一段路要走。但我们有理由相信,将深度学习应用于医疗信息领域的前景是十分广阔的。目前,我国正处于基层医疗水平参差不齐的状态,深度学习技术或许能成为提高基层医疗水平,扩大基层医院业务范围,实现精准医疗的有力工具。 
  主要参考文献 
  [1]Hinton G E, Osindero S, Teh Y W. A fast learning algorithm for deep belief nets[J]. Neural Computation, 2014, 18(7):1527-1554. 
  [2]Lipton Z C, Kale D C, Elkan C, et al. Learning to Diagnose with LSTM Recurrent Neural Networks[J]. Computer Science, 2015. 
  [3]Miotto R, Li L, Kidd B A, et al. Deep Patient: An Unsupervised Representation to Predict the Future of Patients from the Electronic Health Records[R]. Scientific Reports, 2016. 
  [4]Nguyen P, Tran T, Wickramasinghe N, et al. Deepr: A Convolutional Net for Medical Records[J].IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics,2016,21(1). 
  [5]Wu Y,Jiang M, Lei J, et al. Named Entity Recognition in Chinese Clinical Text Using Deep Neural Network[J]. Studies in Health Technology and Informatics, 2015,216:624-628. 
  [6]吴嘉伟,关毅,吕新波.基于深度学习的电子病历中实体关系抽取[J]. 智能计算机与应用,2014,4(3):35-38.

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