辽宁地区满族FGA基因座突变分析 1例��

来源： 2019-02-03 12:23中

　　【摘要】　　目的：探讨FGA基因座突变产生的原因。方法：提取案例中孩子和父亲两份血样DNA，通过PCR扩增和毛细管电泳得到STR基因分型。发现突变后加做遗传标记，同时检测性染色体基因座分型。结果：发现FGA基因座发生1步突变，计算亲权指数大于10000，性染色体分型符合孟德尔遗传规律。结论：鉴定人员应详细记录具体突变情况、被鉴定人的民族等信息，以实现数据共享。
　　【关键词】法医遗传学；满族；FGA基因座；突变
　　【中图分类号】R715 【文献标志码】
　　A 【文章编号】1005-0019（2018）21-233-01
　　Analysis of a mutation in the FGA locus of Manchu in Liaoning area
　　Abstract Objective： Explore the causes of mutations in the FGA locus. Methods：Two blood samples were taken from the child and father in the case， and STR genotyping was obtained by PCR amplification and capillary electrophoresis. After the mutation was found， the genetic marker was added and the sex chromosome locus typing was detected. Results：A 1-step mutation was found in the FGA locus， and the calculated parental index was greater than 10，000. The sex chromosome typing was consistent with Mendelian inheritance. Conclusion：The appraisers should record in detail the specific mutations， the ethnicity of the identified person， and other information to achieve data sharing.
　　Key words：Forensic genetics； Manchu； FGA locus； Mutation
　　目前，STR基因座已被广泛应用于亲子鉴定和个体识别，而相关的鉴定实践显示，越来越多的STR变异现象被人们发现，文献报道的不同地区不同民族的STR基因座频率有不近相同。本实验室在实践中发现一例少数民族基因突变现象，遂对此现象做一分析，以期为少数民族突变数据增加信息。
　　1 材料和方法
　　1.1 基本案情曾某，男，满族，因申报户口需要，要求对其与女儿进行亲权鉴定。
　　1.2 方法
　　1.2.1 DNA提取使用Chelex-100法提取曾某与其女儿两份血样基因座DNA。
　　1.2.2 扩增与分析使用GoldeneyeRRDNA身份鉴定系统20A试剂（基点认知技术（北京）有限公司）复合扩增Amelogenin 基因座和19个STR基因座（）。发现FGA基因座存在突变后，加测MicroreaderTM 23sp-D ID System试剂（阅微基因技术有限公司）和GoldeneyeRRDNA身份鉴定系统17X试剂（基点认知技术（北京）有限公司），扩增体系和热循环反应按照试剂盒说明书进行，扩增产物使用AB 3130XL（美国AB公司）遗传分析仪电泳分离扩增产物，GeneMapper ID-X v1.2软件分析得到分型结果。
　　2 �Y果与分析
　　2.1 常染色体检验结果共检测常染色体38个基因座和性别基因座，检验结果显示阳性对照（9947A、F312）分型正确，阴性对照未见特异性谱带，检材分型如下，分型结果按SF/Z JD0105001-2016《亲权鉴定技术规范》中方法计算累积亲权指数。
　　2.2 性染色体检验结果使用DXS67
　　95等16个X染色体STR基因座和Amelogenin基因座进行检测，检验结果显示阳性对照9948分型正确，阴性对照未见特异性谱带，孩子各基因座等位基因可从曾某的分型中找到来源，检材分型如下。
　　2.3 统计分析常染色体STR遵循孟德尔遗传定律，生物学父亲会将其每个基因座上一对等位基因中的一个随机遗传给孩子，即孩子每个基因座上一对等位基因中的一个来自生父。根据上述分型结果，除FGA基因座外，孩子各基因座等位基因可从曾某的分型中找到来源。在FGA基因座，孩子的基因型为“22”，曾某的基因型为“23，24”，曾某不能提供给孩子必需的等位基因“22”，不符合遗传规律。按照《亲权鉴定技术规范》SF/Z JD0105001-2016中不符合遗传规律情形时亲权指数的计算方法，FGA基因座的亲权指数为0.0030。根据中国满族群体调查数据[1]和汉族群体调查数据[2]，对曾某与孩子检验结果进行统计分析，累积亲权指数为1.65×1012。
　　3 讨论
　　在亲权鉴定实践中，一般认为发现3个或3个以上STR基因座违反孟德尔遗传定律时才得出排除结论。若只有1个或2个STR基因座违反孟德尔遗传规律时，为避免因STR基因突变导致错误地排除亲子关系，应增加遗传标记进行检测，根据所测结果进行综合分析，以排除或认定亲子关系。本案例在应用GoldeneyeRDNA检测系统发现突变后，及时增加MicroreaderTM 23sp-D检测系统，将常染色体检测系统增加至39个基因座，同时又补充检测性别染色体检测系统，以获取更多的遗传信息。　　研究表明，STR基因座发生突变的主要机制是由于�椭苹�链错配，即在DNA复制过程中，DNA聚合酶发生滑脱，重复序列易碱基错配，形成一个或数个重复序列的环状结构，如继续复制，就会出现新生链加长或缩短的现象[3]。本案例中FGA基因座突变为减少一个重复单位，这在STR基因座突变中比较少见，大多数研究结果显示STR基因座突变中重复序列的增加比减少更为常见[4，5]。通常STR基因座核心序列重复次数越多，基因的突变率越高。突变率最高的基因座，同时也是多态性最高的基因座，具有更多的等位基因。目前，常用的STR基因座突变率在0.1%-0.5%。FGA等位基因的范围在12.2-51.2，观察到的等位基因数目达80个，共有69种变异[6]，突变率在0.2%-0.22%之间。根据蔡颖[7]等研究，中国不同地区同一STR基因座突变率无显著差异，但中国人群的突变数据中仅个别标明了研究的民族，民族也是STR基因座突变率差异的原因之一。所以为了更全面的了解中国人群中STR基因座的突变规律，鉴定人员在实际工作中应多加注意，详细记录具体的突变情况、被鉴定人的民族等信息，实现数据共享。
　　参考文献
　　[1] 那春福，魏建生，金萍.辽宁清原县满族19个STR基因座遗传多态性[J].中国法医学杂志，2015，30（5）：511-512.
　　[2] B Xie，L Chen ，Y Yang， et al.Genetic distribution of 39 STR loci in 1027 unrelated Han individuals from Northern China[J].Forensic Science International Genetics，2015，11（19）：205�C206.
　　[3] Jeffreys A J，Barber R，Bois P，et al. Human minisatellites， repeat DNA instability and meiotic recombination[J]. Electrophoresis，2015，20（8）：1665-1675.
　　[4] Lu D，Liu Q，Wu W，etal. Mutation analysis of 24 short tandem repeats in Chinese Han population[J]. International Journal of Legal Medicine，2012，126（2）：331-335.
　　[5] 李茜，程良红，魏天莉，等. 亲子鉴定中STR基因座的基因突变分析[J].中国法医学杂志，2008，23（6）：394-396.
　　[6] 李成涛，郭宏，赵珍敏，等.亲权鉴定中常用STR基因座的基因组学和遗传学分析[J].法医学杂志，2008，24（3