BS-seq的基本原理

试卷相关题目

• 1以下哪一种说法是正确的

  A.一些组蛋白修饰富集的基因组区域是宽阔的，reads分布跨越数万个碱基的较大区域，它们的结合位点呈现宽峰(broad peak)形式。

  B.RNA聚合酶Ⅱ的结合位点是宽峰，能够使用PeakSeq软件进行峰识别

  C.H3K36me3以及H3K4me3的富集区域是宽峰，可以使用SICER、ZINBA软件进行峰识别

  D.大部分转录因子的结合位点呈现混合峰形式，可以使用PeakSeq和ZINBA进行峰识别

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• 2以下哪一种说法是不正确的

  A.H3K4me3信号主要富集在基因的转录起始位点附近，因此基于H3K4me3的峰能够识别基因的启动子

  B.cDNA末端快速扩增实验(rapid amplification of cDNA ends，RACE)能够识别基因的转录起始位点

  C.H3K27ac和H3K9ac信号都能够用于定义增强子区域

  D.H3K36me3可用于定义基因组转录区域

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• 3以下哪一种软件不能用于motif发现

  A.CisGenome

  B.MEME

  C.Scripture

  D.HOMER

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• 4以下哪一个软件是ChIP-seq数据的集成分析工具

  A.Bowtie

  B.IGV

  C.MACS

  D.CisGenome

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• 5以下哪一种新一代测序数据需要去除冗余reads

  A.RNA-seq

  B.ChIP-seq

  C.CLIP-seq

  D.MeDIP-seq

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• 6CLIP-seq主要检测用于检测

  A.DNA与DNA互作

  B.RNA与RNA互作

  C.蛋白质与DNA互作

  D.蛋白质与RNA互作

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• 7下列哪一个不是CIMS的特点

  A.随机分布

  B.同一位点的错配出现在多个read上

  C.交联位点发生替换

  D.交联位点发生插入

  E.交联位点发生缺失

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• 8用CLIP-seq( )检测可应用于miRNA靶位点识别

  A.RNA结合蛋白

  B.mRNA的3’UTR

  C.Ago蛋白

  D.DNA聚合酶Ⅱ

  E.Dicer 酶

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• 9核糖体谱可用于检测

  A.mRNA的翻译

  B.蛋白质与蛋白质结合

  C.mRNA与蛋白质结合

  D.DNA与蛋白质结合

  E.DNA的复制

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