以下哪一个软件是ChIP-seq数据的集成分析工具

试卷相关题目

• 1以下哪一种新一代测序数据需要去除冗余reads

  A.RNA-seq

  B.ChIP-seq

  C.CLIP-seq

  D.MeDIP-seq

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• 2先匹配算法中融合基因的识别的主要步骤不包括

  A.匹配和过滤

  B.融合位点的检测

  C.组装长序列片段

  D.融合基因的组装和选择

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• 3通常将自身序列覆盖融合位点的单个read称为

  A.分离read

  B.配对儿小片段

  C.跨越对

  D.小片段

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• 4以下不能用于识别融合基因的技术是

  A.RNA-seq

  B.全基因测序

  C.靶向测序

  D.ChIP-seq

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• 5可变剪接的主要方式不包括

  A.外显子盒

  B.可变5’供体

  C.内含子保留

  D.多区域去除

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• 6以下哪一种软件不能用于motif发现

  A.CisGenome

  B.MEME

  C.Scripture

  D.HOMER

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• 7以下哪一种说法是不正确的

  A.H3K4me3信号主要富集在基因的转录起始位点附近，因此基于H3K4me3的峰能够识别基因的启动子

  B.cDNA末端快速扩增实验(rapid amplification of cDNA ends，RACE)能够识别基因的转录起始位点

  C.H3K27ac和H3K9ac信号都能够用于定义增强子区域

  D.H3K36me3可用于定义基因组转录区域

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• 8以下哪一种说法是正确的

  A.一些组蛋白修饰富集的基因组区域是宽阔的，reads分布跨越数万个碱基的较大区域，它们的结合位点呈现宽峰(broad peak)形式。

  B.RNA聚合酶Ⅱ的结合位点是宽峰，能够使用PeakSeq软件进行峰识别

  C.H3K36me3以及H3K4me3的富集区域是宽峰，可以使用SICER、ZINBA软件进行峰识别

  D.大部分转录因子的结合位点呈现混合峰形式，可以使用PeakSeq和ZINBA进行峰识别

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• 9BS-seq的基本原理

  A.将未甲基化的尿嘧啶转化成胞嘧啶

  B.将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶

  C.将未甲基化的胸腺嘧啶转化成尿嘧啶

  D.将未甲基化的尿嘧啶转化为胸腺嘧啶

  E.将未甲基化的鸟嘌呤转化成尿嘧啶

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• 10CLIP-seq主要检测用于检测

  A.DNA与DNA互作

  B.RNA与RNA互作

  C.蛋白质与DNA互作

  D.蛋白质与RNA互作

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