生物信息学_分子进化分析

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• 1根据分子时钟假说

  A.所有的蛋白质都保持一个相同的恒定的进化率

  B.所有的蛋白质进化速率都与化石记录相符合

  C.对于每一个给定的蛋白质，分子进化的速率是逐步减慢的，就像一个不准时的时钟一样

  D.对于每一个给定的蛋白质，其分子进化速率在所有的进化分支上是大致恒定的

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• 2下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法

  A.Kimura算法

  B.邻接法

  C.最大似然法

  D.PAUP

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• 3有两个最基本的构建系统发生树的方法：基于距离的和基于字母特征的方法。它们之间的基本差异是

  A.基于距离的方法含有一个用于定义分支顺序的中间数据矩阵，而基于字母特征的方法却没有

  B.基于距离的方法只应用于DNA的数据，而基于字母特征的方法可以应用于DNA或者蛋白质数据

  C.基于距离的方法利用简约算法而基于字母特征的方法却没有

  D.基于距离的方法所产生的进化分支与进化时间长短成比例，而基于字母特征的方法却没有

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• 4病毒在进化研究中很重要，下列选项中错误的是

  A.病毒经常处于强大的选择压力下

  B.高突变率，许多病毒的复制速度也是极其惊人

  C.病毒基因组的进化速度没有其他细胞的基因组快

  D.病毒生命力是很脆弱的，对复杂环境要求很高

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• 5直系同源物定义为

  A.不同物种中具有共同祖先的同源序列

  B.具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列

  C.同一物种中由基因复制产生的同源序列

  D.同一物种中具有相似并且通常是冗余的功能的同源序列

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• 6根据PAM打分矩阵，下列哪个氨基酸最不容易突变

  A.丙氨酸

  B.谷氨酷胺

  C.甲硫氨酸

  D.半胱氨酸

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• 7PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变

  A.0.01

  B.0.2

  C.0.8

  D.2.5

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• 8假如你有两条远相关的蛋白。为了比较它们，最好使用下列哪个BL0SUM和PAM矩阵

  A.BLOSUM45或PAM250

  B.BLOSUM45或PAM1

  C.BLOSUM80或PAM250

  D.BLOSUM10或PAM1

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• 9与PAM打分矩阵比较，BL0SUM打分矩阵的最大区别在哪里

  A.它最好用于比较相关性很近的蛋白

  B.它是基于近相关蛋白的全局多序列比对

  C.它基于远相关蛋白的局部多序列比对

  D.它结合了局部和全局比对的信息

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• 10如果原先使用渐进多序列比对，则肯定可改进比对质量的措施是

  A.使用更多的序列

  B.修改软件的参数

  C.改用迭代法比对软件

  D.改用隐马尔科夫模型软件

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