如果原先使用渐进多序列比对，则肯定可改进比对质量的措施是

试卷相关题目

• 1与PAM打分矩阵比较，BL0SUM打分矩阵的最大区别在哪里

  A.它最好用于比较相关性很近的蛋白

  B.它是基于近相关蛋白的全局多序列比对

  C.它基于远相关蛋白的局部多序列比对

  D.它结合了局部和全局比对的信息

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• 2假如你有两条远相关的蛋白。为了比较它们，最好使用下列哪个BL0SUM和PAM矩阵

  A.BLOSUM45或PAM250

  B.BLOSUM45或PAM1

  C.BLOSUM80或PAM250

  D.BLOSUM10或PAM1

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• 3PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变

  A.0.01

  B.0.2

  C.0.8

  D.2.5

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• 4根据PAM打分矩阵，下列哪个氨基酸最不容易突变

  A.丙氨酸

  B.谷氨酷胺

  C.甲硫氨酸

  D.半胱氨酸

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• 5直系同源物定义为

  A.不同物种中具有共同祖先的同源序列

  B.具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列

  C.同一物种中由基因复制产生的同源序列

  D.同一物种中具有相似并且通常是冗余的功能的同源序列

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• 6基于一致性的比对方法的强项是

  A.它们包含了基于位置相关记分矩阵的信息

  B.它们包含了蛋白质的三维结构信息

  C.它们的速度非常快

  D.它们利用多序列比对过程中产生的信息来指导比对

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• 7基于结构的比对指的是

  A.仅凭序列的结构进行比对

  B.利用序列的结构信息进行比对

  C.用于比较序列相似而结构不相似的序列

  D.用于比较序列不相似而结构相似的序列

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• 8比较几个新确定的氨基酸序列宜使用

  A.MAP2

  B.Murlet

  C.MAFFT

  D.Clustal

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• 9比较几个新确定的RNA序列宜使用

  A.Clustal

  B.Murlet

  C.MUSCLE

  D.ProbCons

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• 10下面的RNA序列算法中耗时最长的是

  A.Infernal

  B.Sankoff

  C.BLAST

  D.GraphClust

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