基于结构的比对指的是

试卷相关题目

• 1基于一致性的比对方法的强项是

  A.它们包含了基于位置相关记分矩阵的信息

  B.它们包含了蛋白质的三维结构信息

  C.它们的速度非常快

  D.它们利用多序列比对过程中产生的信息来指导比对

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• 2如果原先使用渐进多序列比对，则肯定可改进比对质量的措施是

  A.使用更多的序列

  B.修改软件的参数

  C.改用迭代法比对软件

  D.改用隐马尔科夫模型软件

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• 3与PAM打分矩阵比较，BL0SUM打分矩阵的最大区别在哪里

  A.它最好用于比较相关性很近的蛋白

  B.它是基于近相关蛋白的全局多序列比对

  C.它基于远相关蛋白的局部多序列比对

  D.它结合了局部和全局比对的信息

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• 4假如你有两条远相关的蛋白。为了比较它们，最好使用下列哪个BL0SUM和PAM矩阵

  A.BLOSUM45或PAM250

  B.BLOSUM45或PAM1

  C.BLOSUM80或PAM250

  D.BLOSUM10或PAM1

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• 5PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变

  A.0.01

  B.0.2

  C.0.8

  D.2.5

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• 6比较几个新确定的氨基酸序列宜使用

  A.MAP2

  B.Murlet

  C.MAFFT

  D.Clustal

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• 7比较几个新确定的RNA序列宜使用

  A.Clustal

  B.Murlet

  C.MUSCLE

  D.ProbCons

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• 8下面的RNA序列算法中耗时最长的是

  A.Infernal

  B.Sankoff

  C.BLAST

  D.GraphClust

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• 9有两条DNA片段，其中序列S=ATCTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCC，序列T=CCTATGAAAGAAGCCAGTGTCAGAGGACAA，计算其GC含量，则

  A.序列S的GC含量比序列T的高

  B.序列T的GC含量比序列S的高

  C.两条序列GC含量相等

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• 10下列不属于RNA二级结构元件的是

  A.多分枝环

  B.三链结构

  C.发夹环

  D.凸环

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